I. 背景 | |
2019-nCov作为一种新型冠状病毒,是一类具有囊膜、基因组为线性单股正链的RNA病毒,该病毒采集自不同地区患者的病毒样本相关序列也已发布至2019新型冠状病毒信息库(https://bigd.big.ac.cn/ncov)。NCBI收录序列为NC_045512.2,全长29903bp,基因编码4个结构蛋白:S,M,N和E。 为了满足临床诊断的需要,截止目前,国家已经紧急批准了几款核酸诊断试剂盒上市,用于临床诊断,其中多数都是采用RT-PCR的方法,多日的临床检测结果显示,该诊断存在高比例的假阴性问题,往往需要多次的检测,才能被最终验证,同时科技部也是应急征集除普通实时定量荧光PCR外快速诊断产品,理论上ddPCR、NGS、三代测序都能更好的检测病毒,同时监控病毒的变异。 不管是哪一类产品,试剂盒的检测限问题,是造成假阴性的最大根源,因此针对诊断产品的检测限,我们需要认真做每款试剂盒的性能评价。以往针对检测限的性能评价,一般是选择体外转录的RNA、或者临床阳性病毒来作为标准品,用于性能评价。但是两者都具有很明显的确定,首先体外转录的RNA,一般是很纯,单一,不涉及提取,不符合临床病毒的微环境,因此必然造成检测灵敏度被高估,这也是存在高概率假阴性的主要原因;再次临床阳性病毒,即使是灭活的病毒,也是存在很大的生物安全隐患,因此要求实验室级别为P3-P4,大部分开发诊断试剂盒单位都不满足改要求,另外临床阳性病毒也是来源很有限,不能被稳定供应,反复用于试剂盒的性能评价。 |
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II.产品描述 | |
有病毒的完整包膜结构,有2019-nCov对应的核酸序列,但是生物安全风险较低的假病毒标准品,完美的克服了选择体外转录的RNA、或者临床阳性病毒来作为标准品的缺点,非常适合用于核酸诊断新型冠状病毒2019-nCov。 构建过程:2019-nCov基因合成→假病毒包装→纯化→QC检测(ddPCR) |
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III. 产品介绍 | |
产品名称: | 2019-nCov-N Pseudovirus Standard Reference |
对应序列(详情见附录): |
Gene N(1260bp) |
产品规格: | 1ml |
拷贝数: | |
生物安全级别: | P2 |
运输与保存方式: | 干冰运输,-90 ~ -70°C保存 |
有效期: | |
IV. 产品用途与优势 | |
产品用途: | 2019-nCov核酸诊断试剂盒性能评价 |
产品优势: | • 2019-nCov的假病毒标准品,区别于以往体外合成的RNA、临床阳性活病毒,完美克服两者的缺点,真正适合用于试剂盒的性能评价,包含检测限、特异性,重复性等;
• 根据新型冠状病毒的特点,选取了ORF1ab/RdRP(RNA-dependent RNA polymerase)、Gene E(envelope protein)、Gene N(nucleocapsid phosphoprotein)、Gene S、Gene M 5个区段的序列,用于假病毒的包装,5个区段很好的表征了2019-nCov的特征序列; • 公海赌赌船官网jc710设计了ddPCR体系的引物、探针序列,可不需要构建标准曲线的前提下完成对假病毒的QC拷贝数检测,非常准确表征标准品的拷贝数,而且克服了Q-PCR分析CT值的相对判断标准的不准确性; • 假病毒标准品,无致病性,可再生,质控方法可靠,批次间稳定,可以长期稳定制备和供应,而且要求实验室生物安全级别为P2,满足很多单位的安全需求。 |
Ⅴ. 附录 | |
Gene N: ATGTCTGATAATGGACCCCAAAATCAGCGAAATGCACCCCGCATTACGTTTGGTGGACCCTCAGATTCAACTGGCAGTAACCAGAATGGAGAACGCAGTGGGGCGCGATCAAAACAACGTCGG CCCCAAGGTTTACCCAATAATACTGCGTCTTGGTTCACCGCTCTCACTCAACATGGCAAGGAAGACCTTAAATTCCCTCGAGGACAAGGCGTTCCAATTAACACCAATAGCAGTCCAGATGAC CAAATTGGCTACTACCGAAGAGCTACCAGACGAATTCGTGGTGGTGACGGTAAAATGAAAGATCTCAGTCCAAGATGGTATTTCTACTACCTAGGAACTGGGCCAGAAGCTGGACTTCCCTAT GGTGCTAACAAAGACGGCATCATATGGGTTGCAACTGAGGGAGCCTTGAATACACCAAAAGATCACATTGGCACCCGCAATCCTGCTAACAATGCTGCAATCGTGCTACAACTTCCTCAAGGA ACAACATTGCCAAAAGGCTTCTACGCAGAAGGGAGCAGAGGCGGCAGTCAAGCCTCTTCTCGTTCCTCATCACGTAGTCGCAACAGTTCAAGAAATTCAACTCCAGGCAGCAGTAGGGGAACT TCTCCTGCTAGAATGGCTGGCAATGGCGGTGATGCTGCTCTTGCTTTGCTGCTGCTTGACAGATTGAACCAGCTTGAGAGCAAAATGTCTGGTAAAGGCCAACAACAACAAGGCCAAACTGTC ACTAAGAAATCTGCTGCTGAGGCTTCTAAGAAGCCTCGGCAAAAACGTACTGCCACTAAAGCATACAATGTAACACAAGCTTTCGGCAGACGTGGTCCAGAACAAACCCAAGGAAATTTTGGG GACCAGGAACTAATCAGACAAGGAACTGATTACAAACATTGGCCGCAAATTGCACAATTTGCCCCCAGCGCTTCAGCGTTCTTCGGAATGTCGCGCATTGGCATGGAAGTCACACCTTCGGGA ACGTGGTTGACCTACACAGGTGCCATCAAATTGGATGACAAAGATCCAAATTTCAAAGATCAAGTCATTTTGCTGAATAAGCATATTGACGCATACAAAACATTCCCACCAACAGAGCCTAAA AAGGACAAAAAGAAGAAGGCTGATGAAACTCAAGCCTTACCGCAGAGACAGAAGAAACAGCAAACTGTGACTCTTCTTCCTGCTGCAGATTTGGATGATTTCTCCAAACAATTGCAACAATCC ATGAGCAGTGCTGACTCAACTCAGGCCTAA |