I. 背景 | |
Middle East Respiratory Syndrome (MERS) 于2012年在沙特阿拉伯首次报道,此后已传播到包括美国在内的其他几个国家。大多数感染了MERS-CoV的人都出现了严重的呼吸系统疾病,包括发烧,咳嗽和呼吸急促。他们中许多人已经死亡。MERS属于一种冠状病毒,是一类具有囊膜、基因组为线性单股正链的RNA病毒,对应的结构示意图如下:
根据CDC和WHO的介绍,针对MERS的核酸诊断一般是针对RdRP (RNA-dependent RNA polymerase)、Gene N和Gene upE/E, Gene S更多用于对应药物和疫苗的开发。NCBI收录序列为NC_019843.3,全长30119bp,基因编码4个结构蛋白:S,M,N和E。 以往针对试剂盒检测限的性能评价,一般是选择体外转录的RNA、或者临床阳性病毒来作为标准品,用于性能评价。但是两者都具有很明显的确定,首先体外转录的RNA,一般是很纯,单一,不涉及提取,不符合临床病毒的微环境,因此必然造成检测灵敏度被高估,这也是存在高概率假阴性的主要原因;再次临床阳性病毒,即使是灭活的病毒,也是存在很大的生物安全隐患,因此要求实验室级别为P3-P4,大部分开发诊断试剂盒单位都不满足改要求,另外临床阳性病毒也是来源很有限,不能被稳定供应,反复用于试剂盒的性能评价。 |
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II.产品描述 | |
有病毒的完整包膜结构,有MERS对应的核酸序列,但是生物安全风险较低的假病毒标准品,完美的克服了选择体外转录的RNA、或者临床阳性病毒来作为标准品的缺点,非常适合用于核酸诊断性能评价的标准品。 构建过程:MERS基因合成→假病毒包装→纯化→QC检测(ddPCR) |
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III. 产品介绍 | |
产品名称: | MERS-uPE/E Pseudovirus Standard Reference |
对应序列(详情见附录): |
uPE/E(996bp) |
产品规格: | 1ml |
拷贝数: | >1x10e7copies/ml |
生物安全级别: | P2 |
运输与保存方式: | 干冰运输,-90 ~ -70°C保存 |
有效期: | |
IV. 产品用途与优势 | |
产品用途: | MERS诊断试剂盒性能评价 |
产品优势: | • MERS的假病毒标准品,区别于以往体外合成的RNA、临床阳性活病毒,完美克服两者的缺点,真正适合用于试剂盒的性能评价,包含检测限、特异性,重复性等;
• 根据MERS冠状病毒的特点,选取了ORF1ab/RdRP(RNA-dependent RNA polymerase)、Gene E(envelope protein)、Gene N(nucleocapsid phosphoprotein)合计3个区段的序列,用于假病毒的包装,3个区段很好的表征了MERS的特征序列; • 公海赌赌船官网jc710设计了ddPCR体系的引物、探针序列,可不需要构建标准曲线的前提下完成对假病毒的QC拷贝数检测,非常准确表征标准品的拷贝数,而且克服了Q-PCR分析CT值的相对判断标准的不准确性; • 假病毒标准品,无致病性,可再生,质控方法可靠,批次间稳定,可以长期稳定制备和供应,而且要求实验室生物安全级别为P2,满足很多单位的安全需求。 |
Ⅴ. 附录 | |
uPE/E: ATGGCTTTCTCGGCGTCTTTATTTAAACCCGTCCAGCTAGTCCCAGTTTCTCCTGCATTTCATCGCATTGAGTCTACTGACTCTATTGTTTTCACATACATTCCTGCTAGCGGCTATGTAGCTGCTTT AGCTGTCAATGTGTGTCTCATTCCCCTATTATTACTGCTACGTCAAGATACTTGTCGTCGCAGCATTATCAGAACTATGGTTCTCTATTTCCTTGTTCTGTATAACTTTTTATTAGCCATTGTACTAG TCAATGGTGTACATTATCCAACTGGAAGTTGCCTGATAGCCTTCTTAGTTATCCTCATAATACTTTGGTTTGTAGATAGAATTCGTTTCTGTCTCATGCTGAATTCCTACATTCCACTGTTTGACATG CGTTCCCACTTTATTCGTGTTAGTACAGTTTCTTCTCATGGTATGGTCCCTGTAATACACACCAAACCATTATTTATTAGAAACTTCGATCAGCGTTGCAGCTGTTCTCGTTGTTTTTATTTGCACTC TTCCACTTATATAGAGTGCACTTATATTAGCCGTTTTAGTAAGATTAGCCTAGTTTCTGTAACTGACTTCTCCTTAAACGGCAATGTTTCCACTGTTTTCGTGCCTGCAACGCGCGATTCAGTTCCTC TTCACATAATCGCCCCGAGCTCGCTTATCGTTTAAGCAGCTCTGCGCTACTATGGGTCCCGTGTAGAGGCTAATCCATTAGTCTCTCTTTGGACATATGGAAAACGAACTATGTTACCCTTTGTCCAA GAACGAATAGGGTTGTTCATAGTAAACTTTTTCATTTTTACCGTAGTATGTGCTATAACACTCTTGGTGTGTATGGCTTTCCTTACGGCTACTAGATTATGTGTGCAATGTATGACAGGCTTCAATAC CCTGTTAGTTCAGCCCGCATTATACTTGTATAATACTGGACGTTCAGTCTATGTAAAATTCCAGGATAGTAAACCCCCTCTACCACCTGACGAGTGGGTTTAA |